主要研究领域为智能性高分子材料在生物医药领域的应用，近年来在智能性海藻酸钙药物释放体系、可降解高分子材料表面温敏聚合物的接枝反应、生物可降解基底表面的智能性仿生矿化层生长及功能高分子的设计与合成等领域进行了大量研究工作。主持国家自然科学基金、省教育厅自然科学基金等项目4项，通过省级以上鉴定3项；在国外著名期刊上发表学术论文近30篇，其中SCI收录18篇，影响因子3.0以上文章6篇，论文被引用100余次，其中一篇文章作为Inside front cover page发表在Advanced Functional Materials上；另外一篇文章作为cover page发表在Macromolecular Bioscience上。撰写学术专著2部。指导硕士研究生多名。
部分结项及在研项目如下：
1、国家自然科学基金(No.20874090)：基于杂化海藻酸钙的天然高分子智能材料及其生物医用性能研究，资助金额：33万，2009.01-2011.12，主持
2、河南省教育厅自然科学基金(No.2008A430018)：仿生矿化聚糖膜增强海藻酸基双敏微球的可控药物释放研究，资助金额：1万, 主持
3、国家自然科学基金(No.20274042)：含金属光折变共轭聚合物的分子设计与合成，资助金额：23万，2003.01-2005.12，第二完成人
4、2009年度河南省高校青年骨干教师资助计划：无机-有机杂化天然高分子材料的智能药物释放研究，2010.01-2012.12，主持。
主要荣誉：
1、河南省师德先进个人，获河南省教育奖章（河南省教育工会，2009年）
2、河南省中青年骨干教师（河南省教育厅、人事厅，2009年）
3、郑州大学三育人先进个人（郑州大学工会，2009年）
成果清单：
1．发表论文
Jun Shi, Xiaopei Liu, Shaokui Cao, “Hybrid alginate membrane for multi-responsive controlled delivery”, J. Membr. Sci.,352: 262-270 (2010). （影响因子3.2）
Jun Shi, Xiaopei Liu, Ximeng Sun, et al, “Hybrid alginate beads with thermal-responsive gates for smart drug delivery ”, Polym. Adv. Technol., DOI: 10.1002/pat.1677 (2010). （影响因子2.0）
Natália M. Alves, Jun Shi, Oramas Elena, et al, “Bioinspired superhydrophobic poly(L-lactic acid) surfaces control bone marrow derived cells adhesion and proliferation”, J. Biomed. Mater. Res. Part A, 91A (2): 480-488 (2009). （影响因子2.7）
Jun Shi, Lihua Liu, Ximeng Sun, et al, “Biomineralized polysaccharide beads for dual-stimuli-responsive drug delivery”, Macromol. Biosci., 8: 260-267 (2008). （影响因子3.3）
Jun Shi, Natália M. Alves, Jo?o F. Mano, “Chitosan-alginate multilayer beads containing Poly (N-isopropyl- acrylamide) for dual-stimuli-responsive drug release”, J. Biomed. Mater. Res. Part B, 84B (2): 595-603 (2008). （影响因子2.0）
Jun Shi, Lihua Liu, Xiaopei Liu, et al, “Inorganic-organic hybrid alginate beads with LCST near human body temperature for sustained dual-sensitive drug delivery”, Polym. Adv. Technol., 19: 1467-1473 (2008). （影响因子2.0）
Jun Shi, Natália M. Alves, Jo?o F. Mano, “Towards bioinspired superhydrophobic poly(L-lactic acid) surfaces using phase inversion-based methods”, Bioinspiration and Biomimetics, 3: 1-6 (2008).（SCI新期刊）
Li Zhang, Jun Shi, Zhiwei Jiang, et al, “Photorefractive performance of hyperstructured cyclotriphosphazene molecular glasses containing carbazole moieties”, Adv. Funct. Mater., 18: 362-368 (2008). （影响因子6.8）
Li Zhang, Jun Shi, Zheng Yang, et al, “Photorefractive properties of polyphosphazenes containing carbazole-based multifunctional chromophores”, Polymer, 49: 2107- (2008). （影响因子3.3）
Jun Shi, Natália M. Alves, Jo?o F. Mano, “Thermally smart temperature-responsive biomineralization onto biodegradable polymeric substrates”, Adv. Funct. Mater., 17: 3312-3318 (2007). （影响因子6.8）
Jun Shi, Natália M. Alves, Jo?o F Mano, “Drug release behaviour of pH/temperature responsive? semi- ?IPN beads composed of calcium alginate and poly (N-isopropylacrylamide)”, Macromol. Biosci., 6: 358-363 (2006). （影响因子3.3）
Jun Shi, Maomao Huang, Yuanrong Xin, et al, “Synthesis and characterization of a series of carbazole-based monolithic photorefractive molecules”, Mater. Lett., 59, 2199-2203 (2005). （影响因子1.7）
Jun Shi, Yuanrong Xin, Li Zhang, et al, “A post-functionalization strategy to develop carbazole-based photorefractive polymers with low Tg”, React. Funct. Polym., 62: 223-230 (2005). （影响因子2.0）
Jun Shi, Zhiwei Jiang, Li Zhang, et al, “Synthesis and characterization of polymers bearing azobenzene and carbazole groups via post-azo-coupling reaction”, Chin. J. Polym. Sci., 23: 5-9 (2005). （影响因子0.6）
Jun Shi, Zhiwei Jiang, Shaokui Cao, “Synthesis of carbazole-based photorefractive polymers via post-azo-coupling reaction”, React. Funct. Polym., 59: 87-91(2004). （影响因子2.0）
Jun Shi, Maomao Huang, Zhijian Chen, et al, “A carbazole-based azo group-containing single component polymer exhibiting photorefractive performance”, J. Mater. Sci., 39: 3783-3785 (2004). （影响因子1.1）
Jun Shi and Shaokui Cao, “Synthesis of carbazole-based monolithic and fully functional polymeric photorefractive materials”, Trends in Optics and Photonics, 99: Photorefractive Effects, Materials, and Devices, 367-372 (2005). （EI收录）
2．学术专著
1．《有机光折变材料》，科学出版社，2009年，ISBN：978-7-03-025436-8.
2．Jun Shi and Shaokui Cao, “Synthesis of carbazole-based functionalized polymers via a postfunctionalization strategy”, 《Leading Edge Polymer Research》, Nova Science Publishers, chapter 6, 191-212 (2006).